生理性与压力性头皮屑之外，最普通而广发的头皮屑也是真菌感染引起的头皮屑。说到头皮真菌感染之前，我们必须了解什么是微生物？什么是真菌？什么是细菌？这两者之间的区别，然后才能了解真菌感染头皮屑的来龙去脉与治疗方法。
自然界有许多人类肉眼看不到的物质，但这些物质真真切切在人类周围环绕，并影响到人体的健康。于是，生物学家将一切肉眼看不到或者看不清的微小生物称为微生物。比如病毒、细菌、真菌等等（但一些真菌是肉眼可见的，比如我们可以吃的蘑菇、灵芝等菌类植物）。
这些微生物结构简单，小如微尘，不仅沉淀在土壤与水中、漂浮在空气中，也寄生在所有生命之上，医学上可以借助光学显微镜和电子显微镜才能窥见其真容。
大致说来，正常的微生物菌类，比如细菌、真菌、病毒均大量存在人体的表面与内部，其中肠道是微生物菌类聚集最多的地方，这些肠道菌群参与了人体的新陈代谢、肠道运动、免疫功能，调节血糖的生理过程。根据其功能，可划分为有益菌、中性菌、有害菌。一般来说，这三者共同维持肠道的正常功能，保持和谐，一旦发生菌群失调，肠道正常的功能就会出现问题，比如幼儿长期严重的腹泻不止，肠道菌群失调也是主要原因之一。
细菌、真菌与病毒会引起人体诸多疾病，但我们也不可谈菌而色变，特别是真菌，因为较强的分解发酵能力，常用于食物加工，酒类制造，面包发酵之中。但过量的真菌繁殖，也会使人类遭殃，特别是人体的皮肤部位，更是真菌容易过量繁殖，导致皮肤病的重要因素之一。
回到头皮屑问题，人体皮肤上，特别是头皮部位，寄生着一种真菌叫马拉色菌，也称糠皮孢子菌，因为此菌以嗜好油脂为生，俗称嗜脂菌。一般情况下，马拉色菌是人体皮肤上一种正常的菌群，同时参与了皮肤正常的新陈代谢，对角质形成细胞有增值作用。但如果马拉色菌过度繁殖，就会转化为病原菌，成为人体皮肤的致病源。至今确认，被马拉色菌引起的皮肤病有：花斑癣、马拉色菌毛囊炎、脂溢性皮炎、异位性皮炎。银屑病等等。
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回到头皮屑，马拉色菌引起的脂溢性皮炎，就导致非正常的头皮代谢，大量未成熟角质细胞，也就是角质化未完成情况下，整体脱落，形成病理性头皮屑。一般来说，油脂分泌旺盛者，患脂溢性皮炎的机会多，这是基于上面所说，马拉色菌嗜好油脂的原因。这样说来，青年人，或者雄激素异常导致油脂分泌旺盛者，比较容易出现马拉色菌过量繁殖情况。
马拉色菌感染一般在表皮层，这也就是头皮角质化的最后一层。出现马拉色菌感染的头皮屑并不可怕，首先，我们必须找出原因，然后对症施法。一般来说，所有真菌类都喜好温暖潮湿的环境，所以，经历过干燥的秋冬之后，春夏是马拉色菌容易繁殖的季节，特别是油脂分泌旺盛者。我们必须找出是自源性感染还是通过外面不卫生的洗护感染，以杜绝源头。
首先，我们必须将家里公用的梳子、毛巾等日常洗头的用具进行高温消毒，以断源头，防止感染其它人员，特别是家里免疫力差的小孩子。其次，因为马拉色菌类感染常伴随痒痒，切记用手指甲抓绕，过度抓绕不仅会出现头皮红肿、而且会导致更严重的马拉色菌毛囊炎，使单纯的头皮屑雪上加霜，甚至会引起毛囊炎式的脱发。
如果确认是油脂分泌过多引起的马拉色菌头皮屑，建议使用市面上规范的去油脂类型洗发剂，缓解油脂分泌，不给马拉色菌继续过量繁殖提供食物。另外，酮康唑、二硫化硒之类的洗发香波，对抑制马拉色菌有很好的效果。头皮屑缓解后，为了不使产生依赖性，立刻还原，恢复使用日常常规洗发剂。
在洗护治疗的同时，建议养成梳理头皮与按摩头部穴位的习惯，改善头皮微循环。有条件的，多做头疗，多做头皮spa。另外，放松心态，心情开朗，少吃辛辣油腻食物，不熬夜，少烟酒，不给马拉色菌提供繁殖的温床。
